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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

土耳其：瑞典、芬兰未满足土方所提“入约”条件******

　　土耳其媒体17日援引土国防部长胡卢西·阿卡尔的话报道，瑞典和芬兰没有满足土方所提加入北大西洋公约组织的条件，土方希望两国按照先前签署的一份文件履行承诺。

　　土耳其《自由报》援引阿卡尔的话说，土方注意到，瑞典和芬兰没有按照去年6月签署的备忘录履行承诺。土方希望两国采取具体措施，解除对土耳其武器出口禁令并停止支持恐怖组织。

　　阿卡尔还表示，土方谴责瑞典首都斯德哥尔摩上周发生的库尔德工人党示威活动。

　　土耳其政府已就此事召见瑞典驻土大使提出抗议。此外，土检方已启动刑事调查。

　　瑞典和芬兰去年5月申请加入北约，但遭土耳其反对。经多轮谈判，土耳其、瑞典、芬兰去年6月底签署备忘录，确认土耳其同意支持瑞典和芬兰加入北约，瑞典和芬兰将不支持库尔德工人党、叙利亚库尔德武装“人民保护部队”以及“居伦运动”，并同意解除向土耳其出口国防设备的限制。

　　土耳其把库尔德工人党和“人民保护部队”定为恐怖组织，认定“居伦运动”2016年在土耳其发动未遂政变。

　　按照规程，北约必须在30个成员国“一致同意”前提下才能吸纳新成员。目前，土耳其和匈牙利尚未正式批准瑞典和芬兰加入。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）